So wie ich das erkenne, ist der WC nicht richtig mit dem Kork verklebt worden. Auf deinem allerersten Bild, wo man die ausgebrochenen Stellen / Stückchen sieht, hatte der Kork keine Klebeverbindung mit dem WC, deshalb der Ausbruch, meine Vermutung. Auf dem Bild, wo du den WC gelöst hast, sieht man eine Kork-Kork Trennung und keine Trennung des Korkes vom WC, auch keine Ausbrüche. Da ist der WC sauber verklebt worden, leider nicht ringsum. Deutet auf schlechte Qualität in der Verarbeitung hin.
Ich würde den WC entfernen und eine Rubberkorkscheibe, hell oder dunkel nach Geschmack, passgenau anfertigen und schlitzen. Den vorhandenen Korkgriff ebenen, plan abschneiden und die Scheibe mit 2K-Kleber davor kleben. Wenn du den Blankdurchmesser als Bohrung passgenau in den Rubberkork übertragen kannst, benötigst du auch keinen WC. Das wäre die einfachste Lösung, aber nicht mehr. Fachgerecht und ordentlich wäre ein komplett neuer Aufbau an dieser Stelle, dies würde ich persönlich bevorzugen.